(二)工程總承包合同價款的結算
　　合同雙方約定由承包人提交履約保函的，履約保函的提交是發包人支付各項款項的前提條件。
　　1．預付款
　　(1)預付款的支付時間及額度。發包人按合同價格的一定比例支付預付款金額，具體金額由雙方在合同專用條款中約定。合同約定了預付款保函的，在合同生效后，發包人收到承包人提交的預付款保函后10日內向承包人支付預付款金額；未約定預付款保函的，發包人在合同生效后10日內向承包人支付預付款金額。
　　(2)預付款的抵扣。預付款的抵扣方式、抵扣比例和抵扣時間安排，由合同雙方在專用條款中約定。預付款抵扣完后，發包人應及時向承包人退還預付款保函。在發包人簽發工程接收證書或合同解除時，預付款尚未抵扣完時，發包人有權要求承包人支付尚未抵扣完的預付款。承包人未能支付的，發包人有權按如下程序扣回預付款的余額：
　　1)從應付給承包人的款項中或屬于承包人的款項中一次或多次扣除。
　　2)應付給承包人的款項或屬于承包人的款項中不足以抵扣的，發包人有權從預付款保函中扣除尚未抵扣完的預付款。
　　3)應付給承包人或屬于承包人的款項不足以抵扣，且合同未約定承包人提交預付款保函的，承包人應與發包人簽訂支付尚未扣完的預付款支付時間安排協議書。
　　4)承包人未能按上述協議書執行，發包人有權從承包人提交的履約保函中抵扣尚未扣完的預付款。
　　2．工程進度款的支付
　　(1)進度款的支付方式?！犊偝邪贤痉段谋尽芬幎藘煞N進度款的支付方式供發承包雙方選擇適用：
　　1)按月申請付款。按月申請付款，承包人應以合同協議書約定的合同價格為基礎，按每月實際完成的工程量(含設計、采購、施工、竣工試驗和竣工后試驗等)的合同金額，向發包人或監理人提交付款申請。承包人提交付款申請報告的格式、內容、份數和時間，在專用條款約定。
　　按月付款申請報告中的款項包括：①工程進度款的款項類別；②合同價格調整的增減款項；③預付款的支付及扣減的款項；④缺陷責任保修金約定的暫扣及支付的款項；⑤索賠結果所增減的款項；⑥另行簽訂的補充協議增減的款項。
　　2)按付款計劃表申請付款。按付款計劃表申請付款的，承包人應以合同協議書約定的合同價格為基礎，按照在專用條款約定的付款期數、計劃每期達到的主要形象進度和(或)完成的主要計劃工程量(含設計、采購、施工、竣工試驗和竣工后試驗等)等目標任務，以及每期付款金額，并依據專用條款約定的格式、內容、份數和提交時間，向發包人或監理人提交當期付款申請報告。
　　每期付款申請報告中的款項包括：①當期計劃申請付款的金額；②合同價款調整的增減款項；③預付款的支付及扣減的款項；④質量保修金額的暫扣及支付的款項；⑤索賠結果所增減的款項；⑥另行簽訂的補充協議增減的款項。發包人按付款計劃表付款時，承包人的實際工作和(或)實際進度比付款計劃表約定的關鍵路徑的目標任務落后30日及以上時，發包人有權與承包人商定減少當期付款金額，并有權與承包人共同調整付款計劃表。承包人以后各期的付款申請及發包人的付款，以調整后的付款計劃表為依據。
　　(2)進度款的支付程序。
　　1)按月工程進度申請與付款。合同約定按月工程進度申請付款和付款時，發包人在收到承包人提交的每月付款申請報告之日起的25天內審查并支付。
　　2)按付款計劃表申請與付款。合同約定按付款計劃表申請付款和付款時，發包人在收到承包人提交的每期付款申請報告之日起的25天內審查并支付。
　　(3)付款時間延誤的處理。
　　1)發包人的違約責任。因發包人的原因未能按合同約定的時間向承包人支付工程進度款的，應從發包人收到付款申請報告后的第26日開始，以中國人民銀行頒布的同期同類貸款利率向承包人支付延期付款的利息，作為延期付款的違約金額。
　　2)暫停施工。發包人延誤付款15天以上，承包人有權向發包人發出要求付款的通知，發包人收到通知后仍不能付款的，承包人可暫停部分工作，視為發包人導致的暫停，并按合同中關于發包人暫停的約定執行。
　　3)協議延期付款。雙方協商簽訂延期付款協議書的，發包人按延期付款協議書中約定的期數、時間、金額和利息付款；當雙方未能達成延期付款協議，導致工程無法實施，承包人可停止部分或全部工程，發包人承擔違約責任，導致工程關鍵路徑延誤時，竣工日期順延。
　　4)合同解除。發包人的延誤付款達60天以上，并影響到整個工程實施的，承包人有權根據合同的約定向發包人發出解除合同的通知，并有權就因此增加的相關費用向發包人提出索賠。
　　3．缺陷責任保修金
　　(1)缺陷責任保修金的暫時扣減。發包人可根據合同專用條款中約定的缺陷責任保修金金額以及暫扣的方式，暫時扣減缺陷責任保修金。
　　(2)缺陷責任保修金的支付。發包人應在辦理工程竣工驗收和竣工結算時，將暫時扣減的全部缺陷責任保修金金額的一半支付給承包人，專用條款另有約定的除外。此后，承包人未能按發包人通知修復缺陷責任期內出現的缺陷或委托發包人修復該缺陷的，修復缺陷的費用從剩余的缺陷責任保修金金額中扣除。發包人應在缺陷責任期屆滿后l5日內，將暫扣的缺陷責任保修金余額支付給承包人。
　　(3)缺陷責任期保修金保函。在辦理工程竣工驗收和竣工結算時，如承包人請求提供用于替代剩余的缺陷責任保修金的保函，發包人應在接到承包人按合同約定提交的缺陷責任保修金保函后，向承包人支付缺陷責任保修金的剩余金額。此后，承包人未能自費修復缺陷責任期內出現的缺陷或委托發包人修復該缺陷的，修復缺陷的費用從該保函中扣除。發包人應在缺陷責任期屆滿后15日內，退還該保函。
　　4．索賠款項的支付
　　(1)發包人的索賠款項。經雙方協商確定的、經調解確定的或經仲裁裁定(或法院判決)的發包人應得的索賠款項，發包人可從支付給承包人的當月工程進度款或當期付款計劃表的付款中扣減該索賠款項。當支付給承包人的各期工程進度款中不足以抵扣發包人的索賠款項時，承包人應當另行支付。承包人未能支付，可協商支付協議，仍未支付時，發包人可從履約保函中抵扣。如未約定履約保函或履約保函不足以抵扣時，承包人須另行支付該索賠款項，或以雙方協商一致的支付協議的期限支付。
　　(2)承包人的索賠款項。經雙方協商確定的、經調解確定的或經仲裁裁定(或法院判決)的承包人應得的索賠款項，承包人可在當月工程進度款或當期付款計劃表的付款申請中單列該索賠款項，發包人應在當期付款中支付該索賠款項。當發包人未能支付該索賠款項時，承包人有權從發包人提交的支付保函中抵扣。如未約定支付保函時，發包人須另行支付該索賠款項。
　　5．竣工結算
　　(1)竣工結算的程序。
　　1)提交竣工結算資料。承包人提交的竣工驗收報告和完整的竣工資料被發包人認可后30日內，向發包人遞交竣工結算報告和完整的竣工結算資料。承包人未能向發包人提交竣工結算報告及完整的結算資料，造成工程竣工結算不能正常進行或工程竣工結算不能按時結清，發包人要求承包人交付工程的，承包人應當交付；發包人未要求交付工程的，承包人應當承擔工程的保管、維護和保養的費用和責任，但不包括已被發包人使用、接收的單項工程和工程的任何部分。
　　2)最終竣工結算資料。發包人應在收到承包人提交的竣工結算報告和完整的竣工結算資料后30日內，經審查并提出修改意見，雙方就竣工結算報告和最終的結算資料的修改達成一致意見后，由承包人自費進行修正，并提交最終的竣工結算報告和最終的結算資料。發包人在30日內未能提出修改意見，也未予答復的，視為發包人認可該竣工結算資料作為最終竣工結算資料。
　　3)結清竣工結算的款項。發包人應在收到承包人提交的最終竣工結算資料后30日內，結清竣工結算的款項?？⒐そY算結清5日內，發包人應將承包人提交的履約保函返還給承包人；發包人如果提交了支付保函的，承包人應將發包人提交的支付保函返還給發包人。
　　(2)竣工結算的違約責任。
　　1)發包人違約。發包人未能按照合同的約定結清應付給承包人的竣工結算的款項余額的，承包人有權從發包人提交的支付保函中扣減該款項的余額。合同未約定支付保函或支付保函不足以抵償應向承包人支付的竣工結算款項時，發包人應從承包人提交最終結算資料后的第31日起，支付拖欠的竣工結算款項的余額，并按中國人民銀行同期同類的貸
　　款利率支付相應利息。
　　在收到承包人提交的竣工結算報告和完整的竣工結算資料后30日內，發包人未能對竣工結算資料提出修改意見和答復，也未能向承包人支付竣工結算款項的余額的，應從承包人提交該報告后的第31日起，支付拖欠的竣工結算款項的余額，并按中國人民銀行同期同類的貸款利率支付相應利息。
　　發包人在承包人提交最終竣工結算資料的90日內仍未支付的，承包人可依據合同中有關爭議和裁決條款的約定解決。
　　2)承包人違約。承包人未能結清應付給發包人的竣工結算中的款項余額時，發包人有權從承包人提交的履約保函中扣減該款項的余額。合同未約定履約保函或履約保函的金額不足以抵償時，承包人應從最終竣工結算資料提交之后的31日起，支付拖欠的竣工結算款項的余額，并按中國人民銀行同期同類的貸款利率支付相應利息。承包人在最終竣工結算資料提交后的90日內仍未支付的，發包人有權根據合同中有關爭議和裁決條款的約定解決。
　　(3)竣工結算的爭議。在發包人收到承包人遞交的竣工結算報告及完整的結算資料后的30日內，雙方對工程竣工結算的價款發生爭議的，應共同委托一家具有相應資質等級的工程造價咨詢單位進行竣工結算審核，按審核結果結清竣工結算的款項。審核周期由合同雙方與工程造價審核單位約定。對審核結果仍有爭議時，依據合同中有關爭議和裁決條款的約定解決。