一、進項稅額的計算：
（一）準予從銷項稅中抵扣的進項稅額：
1、從銷售方取得的增值稅專用發票的增值額
2、從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值額。
3、購進農產品，除去增值稅專用發票或海關進口增值稅專用繳款書外，按照農產品收購發票或銷售發票的買價和13%的扣除率計算進項稅。
進項稅額=買價*13%（扣除率）
特殊情況：農產品的買價包括收購發票或者銷售發票注明的金額和按規定繳納的煙葉稅。
煙葉收購金額=煙葉收購價款*（1+10%）
煙葉應納稅額=煙葉收購金額*20%（稅率）
準予抵扣的進項稅額=（煙葉收購金額+煙葉應納稅額）*13%（扣除率）
4、購進或者銷售貨物以及在生產經營過程中支付的運輸費用，按運輸計算單據上面的運輸費用和7%的扣除率計算進項稅額。
進項稅額=運輸費用金額*7%（扣除率）
注意：1購買或銷售免稅貨物（免稅農產品除外）所發生的運輸費用，不得計算進項稅抵扣。
2一般納稅人購買固定資產支付的運輸費，伴隨著消費型增值稅的實施，也可以按7%計算抵扣進項。
3一般納稅人在生產經營中支付的運輸費，允許抵扣進項稅。
4增值稅抵扣的貨運發票，必須是通過貨運發票稅控系統開具的新版貨運發票，一般納稅人取得的國際貨物運輸代理業發票和國際貨物運輸發票不得抵扣。
5一般納稅人購進或銷售貨物，取得的是營改增試點運輸企業開具的增值稅專用發票的，以票抵扣進項稅。
（二）不得從銷項稅額中抵扣的進項稅額
1用于非增值稅應稅項目，免征增值稅項目，集體福利或者個人消費的購進貨物或者應稅勞務。
設備用于在建工程的可以抵扣，納稅人新建，改建，擴建，修繕，裝飾不動產的，均屬于不動產在建工程，不可抵扣。
2非正常損失的購貨及相關的應稅勞務（管理不善造成的）
3非正常損失的在產品，產成品所含用的購進貨物或者應稅勞務。
4國務院財政，稅務主管部門規定的納稅人自用消費品、（如摩托車，汽車，游艇）
（不得抵扣的，需做進項稅轉出，在企業所得稅中，可將轉出的進項稅計入企業損失-營業外支出，在企業所得稅前抵扣。）
5一般納稅人兼營免稅項目或者非增值稅應稅勞務而無法劃分不得抵扣的進項稅額的：
不得抵扣的進項稅額=當月無法劃分的全部進項稅*當月免稅項目銷售額、非增值稅應稅勞務營業額合計/當月全部銷售額、營業額合計
進項稅轉出額=當期實際成本*稅率
例題1本月從國營農場購進免稅農產品，取得發票價款10萬，運費支付1萬，裝卸費用2000，并取得運費發票，該農產品60%用于商場內部餐飲中心，40%用于對外銷售。本月商場可以抵扣的進項稅額是多少？
可以抵扣的進項稅額=（10*13%+1*7%）*（1-60%）=5480
例題2企業因管理不善庫存原材料損失618.6萬，其中含運費成本18.6萬，
應轉出的進項稅=（618.6-18.6）*17%+18.6/93%*7%=103.4
如果是免稅農產品損失，應轉出的進項稅=（618.6-18.6）/87%*13%+18.6/93%*7%=91.05
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