由于免抵稅額的存在，直接減少了企業當期內銷的“應納稅額”，而企業應納稅額是計算城建稅的依據，所以這個“免抵稅額”應該作為城建稅的計稅依據，不能因為征管方式的改變而減少城建稅的計數基數。
免抵稅額沒有實際意義，在會計處理上只為平衡會計分錄。
當期免抵稅額，是當期應交的內銷增值稅，抵減了應退的出口退稅。
舉個例子，假如企業對內銷和出口分開核算。
本期內銷的銷售額＝500萬元，為內銷而購進的貨物＝400萬元，為外銷而購進的貨物為450萬元，外銷的出口額為450萬元。退稅率為13%。假如企業是分別核算的，則內銷應交的增值稅＝500*0.17-400*0.17＝17（萬元）
外銷的應退稅額＝450*0.13＝58.5（萬元 ）
則企業本月要交17萬元稅款的“錢”，同時收到58.5萬元的退稅款的“錢”。綜合來看，企業的“錢”是增加了41.5萬元。如果按照“免、抵、退”計算出口不得免征和抵扣的稅額＝450×（17%－13%）＝18（萬元 ）
本期的增值稅進項稅＝400*0.17+450*0.17＝144.5（萬元）
本期應交的增值稅：a＝500*0.17－（144.5－18）＝－41.5（萬元）
本期“免、抵、退”稅額：b＝450×0.13＝58.5 （萬元）
本期應交的增值稅a<本期“免、抵、退”稅額b
則按照較小的數41.5萬元退稅。企業也是收到了41.5萬元退稅款的“錢”。
同時本期免抵稅額＝本期“免、抵、退”稅額b58.5－41.5＝17（萬元）
可見這免抵稅額17萬元正是第一種方法計算時的內銷應交增值稅。
但實際上，對于企業來說，真正有意義的是退稅額，免抵稅額對企業是沒有太大意義的。這個數額在財務上的最大貢獻是平衡賬務，因為實行“免抵退”政策實際有三種情況：
A、應納稅額為正數，即免抵后仍應交增值稅，這時免抵稅額=免抵退稅額，即沒有可退稅額（因為沒有留抵稅額），這時帳務處理為：
借：應交稅費——應交增值稅（出口免抵稅額）
貸：應交稅費——應交增值稅（出口退稅）
B、應納稅額為負數，即期末有留抵稅額，留抵稅額大于“免抵退”稅額時：可全部退稅，這時免抵稅額為0，帳務處理為：
借：應收外匯賬款或其他應收款－—出口退稅
貸：應交稅費——應交增值稅（出口退稅）
C、應納稅額為負數，即期末有留抵稅額，留抵稅額小于“免抵退”稅額時：可退稅額為留抵稅額，免抵稅額=“免抵退”稅額-留抵稅額，帳務處理為：
借：應收出口退稅
應交稅費——應交增值稅（出口免抵稅額）
貸：應交稅費——應交增值稅（出口退稅）
通過以上三種情況的分析，可看出如果不計算出“免抵稅額”，在財務處理時將無法平衡。
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