納稅人合并、分立是比較常見的現象，但對于符合條件的轉型企業來說，將會影響新增增值稅稅額的基數的計算。《中部地區擴大增值稅抵扣范圍暫行辦法》規定，現有納稅人發生下列情形的，納稅人應分別計算確定新增增值稅稅額的基數：1.納稅人與其他企業合并的，以納稅人和其他企業合并前上年同期應繳增值稅累計稅額之和為基數；2.納稅人分立為兩個以上新企業的，如果新企業在中部六省老工業基地城市范圍內，以新企業分立后的資產余額占分立前納稅人資產余額的比重與分立前納稅人上年同期應繳增值稅稅額的乘積為基數；3.納稅人改變企業名稱的，以納稅人發生變更前上年同期應繳增值稅為基數。

如某企業分立為A、B兩家企業，且都在試點地區內，A企業資產余額占原企業的40%，原企業上年應繳增值稅為1000萬元，而分立后A企業當年應繳增值稅為600萬元，則A企業新增增值稅稅額為600-1000×40%=200萬元。

試點地區納稅人當年準予抵扣的進項稅額一般不超過當年新增增值稅稅額，當年沒有新增增值稅稅額或新增增值稅額不足抵扣的，未抵扣的進項稅額應留待下年抵扣。如果當期固定資產進項稅較大，而當期增量較小的話，就不能及時抵扣，在連年增量不大的情況下，甚至永遠都不可能抵扣，這也是增量抵扣的局限性。

但分立、合并的有關規定給納稅人提供了一定的籌劃空間，將是轉型試點納稅人用足用活增量抵扣政策的重要措施，符合條件的企業，可以選擇合并、分立企業的辦法，實現進項稅額的最大限度退稅。企業在可能的情況下，可以合并增值稅增長潛力大的企業，實現增值稅的大增量，或者將增值稅增長潛力大、占用資產比重小的分支機構分立出去，分出較小的基數，以實現后期購進固定資產進項稅額盡量多的退稅。

如某企業主要生產A、B兩種產品，分別是兩條完全獨立的生產線，本年準備新上馬C產品生產線，并投入使用。上年應繳增值稅為2000萬元，預測當年可以實現應繳增值稅2500萬元，增量為500萬元，可扣除固定資產進項稅限額為500萬元。本年新增C產品生產線固定資產進項稅為600萬元。按現有狀況，將有600－500＝100萬元不能當年扣除。

經過對企業的資產結構進行分析，發現生產A產品的生產線占30%的資產，增值潛力大，本年可實現增值稅1500萬元；生產B產品的生產線占70%的資產，增值潛力小，本年僅可實現增值稅1000萬元。

如果將企業進行分立，由增值潛力大的30％的資產和增值潛力小的70％的資產各成立一家企業，C生產線則由增值潛力大的新公司購進。則有如下的計算結果，30％的資產新分立企業當年計算增量為1500－2000×30%＝900萬元，當年新增固定資產進項稅600萬元，小于增量，可以當年全部扣除。另外70％的資產新分立企業當年計算增量1000－2000×70%＝－400萬元，因沒有固定資產購進，也不用考慮抵扣問題。

與分立相反，如果企業存在沒有增量或者增量較小而本期又有較大金額的固定資產購進時，可以采取合并措施，與增量較大而固定資產購進較小的企業通過合并來實現固定資產進項最大限度的抵扣。