按照規定，企業應在“應交稅金”科目下設置“應交增值稅”明細科目。“應交稅金——應交增值稅”科目的借方發生額，反映企業購進貨物或接受應稅勞務支付的進項稅額和實際已交納的增值稅；貸方發生額，反映銷售貨物或提供應稅勞務應交納的增值稅額、出口貨物退稅、轉出已支付或應分擔的增值稅；期末借方余額，反映企業多交或尚未抵扣的增值稅；期末貸方余額，反映企業尚未交納的增值稅。
在“應交稅金——應交增值稅”明細賬中，應設置“進項稅額”、“已交稅金”、“銷項稅額”、“出口退稅”、“進項稅額轉出”等專欄。其中：“進項稅額”專欄，記錄企業購入貨物或接受應稅勞務而支付的、準予從銷項稅額中抵扣的增值稅額。企業購入貨物或接受應稅勞務支付的進項稅額，用藍字登記；退回所購貨物應沖銷的進項稅額，用紅字登記。
“已交稅金”專欄，記錄企業已交納的增值稅額。企業已交納的增值稅額用藍字登記；退回多交的增值稅額用紅字登記。
“銷項稅額”專欄，記錄企業銷售貨物或提供應稅勞務應收取的增值稅額。企業銷售貨物或提供應稅勞務應收取的銷項稅額，用藍字登記；退回銷售貨物應沖銷銷項稅額的，用紅字登記。
“出口退稅”專欄，記錄企業出口適用零稅率的貨物，向海關辦理報關出口手續后，憑出口報關單等有關憑證，向稅務機關申報辦理出口退稅而收到退回的稅款。出口貨物退回的增值稅額，用藍字登記；出口貨物辦理退稅后發生退貨或者退關而補交已退的稅款，用紅字登記。
“進項稅額轉出”專欄，記錄企業的購進貨物發生非正常損失以及其他原因而不應從銷項稅額中抵扣，按規定轉出的進項稅額。
企業也可以將“進項稅額”、“已交稅金”、“銷項稅額”、“出口退稅”、“進項稅額轉出”等專欄內容在“應交稅金”科目下分別設置明細科目進行核算。在這種情況下，企業可沿用三欄式賬戶，在月份終了時，再將有關明細賬的金額結轉到“應交稅金——應交增值稅”科目。
小規模納稅人商品流通企業可在“應交稅金”科目下設置“應交增值稅”明細科目，仍可沿用三欄式賬戶，核算企業應交、已交及多交或少交的增值稅。
二、賬務處理方法
（一）進項稅額的核算
1.企業從國內購進商品：
借：商品采購等
應交稅金——應交增值稅（進項稅額）
貸：銀行存款等
2.企業接受投資轉入貨物：
借：應交稅金——應交增值稅（進項稅額）
庫存商品等
貸：實收資本
3.企業接受捐贈的貨物：
借：應交稅金——應交增值稅（進項稅額）
庫存商品等
貸：資本公積
4.企業接受應稅勞務（提供加工、修理修配勞務）：
借：應交稅金——應交增值稅（進項稅額）
加工商品等
貸：銀行存款等
5.購進免稅農業產品：
借：應交稅金——應交增值稅（進項稅額）
商品采購等
貸：銀行存款等
6.企業進口貨物：
借：應交稅金——應交增值稅（進項稅額）
商品采購等
貸：銀行存款等
7.企業購入固定資產：
借：固定資產
貸：銀行存款等
8.企業購入貨物或接受應稅勞務直接用于非應稅項目，或直接用于免稅項目以及直接用于集體福利和個人消費：
借：商品采購等
貸：銀行存款等
9.小規模納稅人企業購入貨物及接受應稅勞務：
借：商品采購等
貸：銀行存款等
10.企業購入貨物或接受應稅勞務沒有取得專用發票，而取得普通發票（不包括購入免稅農業產品）：
借：商品采購等
貸：銀行存款等
（二）銷項稅額核算
1.企業向外銷售貨物或提供應稅勞務：
借：銀行存款等
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
商品銷售收入等
2.企業將委托加工或購買的貨物分配給股東或投資者：
借：應付利潤
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
商品銷售收入等
3.小規模納稅企業對外銷售貨物或提供應稅勞務：
借：銀行存款等
貸：應交稅金——應交增值稅
商品銷售收入等
4.企業將自產或委托加工貨物用于非應稅項目，按規定應視同銷售計算應交增值稅。其會計處理方法有兩種：一種是將自產或委托加工貨物用于非應稅項目，直接作銷售處理，則：
借：在建工程等
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
商品銷售收入等
另一種方法，是企業將自產或委托加工貨物用于非應稅項目，一方面按稅法要求按銷售同類貨物價格計算應納稅額，另一方面按自產或委托加工貨物的成本直接結轉其成本，不作銷售處理。則會計分錄為：
借：在建工程等
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
庫存商品等
企業可根據具體情況確定。
5.企業將自產、委托加工的或購買的貨物作為投資，提供給其他單位和個體經營者，按規定應視作銷售計算應納增值稅：
借：長期投資
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
商品銷售收入等
或：
借：長期投資
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
庫存商品等
6.企業將購進、委托加工貨物用于集體福利等，按規定應視同銷售貨物計算應交增值稅。則：
借：應付福利費等
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
商品銷售收入等
或：
借：在建工程
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
庫存商品等
7.企業將自產、委托加工或購買的貨物無償贈送他人，應視同銷售貨物計算應交增值稅：
借：營業外支出
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
商品銷售收入等
或：
借：營業外支出
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
庫存商品等
8.企業隨同商品出售但單獨計價的包裝物，按規定應交納增值稅：
借：銀行存款等
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
其他業務收入
企業逾期未退還的包裝物押金，按規定應交納的增值稅額：
借：其他應付款
貸：應交稅金——應交增值稅（銷項稅額）
營業外收入
（三）出口退稅的核算
按照規定，企業出口適用零稅率的貨物，不計算銷售收入應交納的增值稅。企業在向海關辦理報關出口手續后，憑出口報關單等有關憑證，向稅務機關申報辦理該項出口貨物的進項稅額的退稅，企業在收到出口貨物退回稅款時：
借：銀行存款
貸：應交稅金——應交增值稅（出口退稅）
企業已辦理出口退稅后，發生退貨或退關的，應補交已退回的稅款：
借：應交稅金——應交增值稅（出口退稅）
貸：銀行存款
（四）進項稅額轉出的核算
企業購進的商品改變用途，用于在建工程、職工福利等，其進項稅額應相應轉入有關科目：
借：在建工程
或應付福利費
貸：應交稅金——應交增值稅（進項稅額轉出）
企業在財產清查中發現的庫存商品等盤虧，按規定應轉作“待處理財產損溢——流動資產損失”科目，其進項稅額也應相應轉入“待處理財產損溢——流動資產損失”科目，其會計分錄為：
借：待處理財產損溢——流動資產損失
貸：應交稅金——應交增值稅（進項稅額轉出）
庫存商品等
（五）交納增值稅稅額的核算
一般納稅人商品流通企業按規定預繳增值稅時：
借：應交稅金——應交增值稅（已交稅金）
貸：銀行存款
次月初結算上月稅款時需要補交稅款時，作與上述同樣分錄；收到退回多交的稅款時，作如下會計分錄：
借：銀行存款
貸：應交稅金——應交增值稅（已交稅金）
小規模納稅人商品流通企業預繳稅款時，作如下會計分錄：
借：應交稅金——應交增值稅
貸：銀行存款
次月初結算時需要補交稅款的，按補交稅款作同樣分錄；需要退回多交的稅款的，在收到退回的稅款時，作會計分錄：
借：銀行存款
貸：應交稅金——應交增值稅
三、會計報表
按照規定，企業應設置“應交增值稅明細表”，作為資產負債表的附表。
